位於城東明故宮旁邊，是中國國內最負盛名的幾家博物院之一，民國時候的國立博物院，與故宮博物院，上海博物館齊名。
博物院目前有各類藏品42萬件（上海博物院是20萬），國寶級文物和國家一級文物有二千件以上，其中考古發掘品、少數民族文物、外國文物、宮廷器皿、清代文書以及日寇投降儀式的文物，都是全國獨有的罕見品，科學價值較高。院藏中外專業圖書近30萬冊，其中還有全國少有的善本書和殿版書。南京博物館集中全國第一流珍品約二、三十萬件，其中包括繪畫中的《歷代帝后像》、《唐明皇幸蜀圖》；銅器中的《毛公鼎》、《司母戊鼎》等稀世國寶。一批著名專家雲集於此，如李濟、吳金鼎、夏鼐、曾昭橘、王天木等。在**戰爭內遷西南期間，進行考古發掘、民族調查，並出版有《雲南蒼洱境考古報告》、《麼些象形文字字典》、《博物館》等許多專著。
近年來經過修葺後的博物館頂蓋金色琉璃，門仿漢闕，綠樹蔥蘢，月台前拱。門前面向通往東郊明孝陵和中山陵的林蔭大道，滬寧高速公路經門口穿過而進入市內繁華地區；門內庭園廣闊，花木蔥蔥似錦，襯托出仿遼式宮殿建築的陳列大殿的端嚴和壯觀 |
